در پی رهنمودهای بسیار مهم هفته‌ی گذشته حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی در آغاز مجدد درس خارج ،که طی آن حوزه های علمیه را به بازنگری عمیق و اندیشمندانه در مواد درسی، برنامه ریزی صحیح و منظم، توجه جدی به علوم گوناگون اسلامی، آگاهی از پیشرفتهای جهان در مسائل مرتبط با علوم اسلامی و نیز تخصصی شدن رشته های مختلف علمی فراخوانده بودند، پیش از ظهر امروز آیت‌الله مشکینی به اتفاق اعضاء جامعه مدرسین حوزه علمیه قم و آیت‌الله فاضل دبیر شورای مدیریت این حوزه با معظم له دیدار کردند.
در این دیدار که درخصوص شیوه های اصلاح برنامه های حوزه بحث و گفتگو شد، مقام معظم رهبری طی سخنانی ضمن اظهار خرسندی و سپاس الهی از اینکه اصل برنامه اصلاح و برنامه ریزی در حوزه علمیه مورد قبول و اتفاق همه ی اساتید وفضلای حوزه می‌باشد، فرمودند: آنچه که مهم می باشد این است که با توجه به این اصل متفقاً باید کیفیت و شیوه های اصلاح برنامه ریزی در حوزه علمیه را بطور جدی مورد تعمق و بررسی قرار داد. و اینکار تنها در صورتی عملی است که گروهی از اساتید و فضلای لایق، صالح و درد آشنا، فارغ از سایر مشاغل تمام تلاش و همت خود ر ابر اینامر مهم متمرکز کنند و پیرامون اهداف اصلاح حوزه، طرح کلی آن و برنامه ریزی صحیحو منظم براساس آن به یک نتیجه ی نهایی و واحدی برسند.
حضرت آیت الله خامنه ای باتأکید بر اینکه خوشبختانه اساتید و فضلایی که قادر به اصلاح برنامه ریزی حوزه در زمینه های مختلف باشند در حوزه و جامعه مدرسین حوزه علمیه قم کم نیستند، افزودند:اگر این کار بسیار مهم بخوبی انجام پذیرد در حقیقت مقدمات اصلی کار فراهم شده و در پی آن می توان با تمام توان ابزارها و لوازم مناسب برنامه اصلاح حوزه را فراهم کرد و بکار گرفت.