رهبر معظم انقلاب اسلامی طی حکمی وزیر کشور را به سمت جانشین فرماندهی کل قوا در امور نیروی انتظامی منصوب کردند.
متن نامه مصطفی محمدنجار به محضرمقام معظم رهبری و پاسخ حضرت آیت‌الله خامنه‌ای بدین شرح است:

«محضر مبارک رهبر معظم انقلاب اسلامی
حضرت آیت الله العظمی خامنه ای مدظله العالی
با اهداء سلام و تحیات الهی
احتراماً به استحضار می رساند: با عنایت به مسئولیت قانونی و خطیر وزارت کشور در تأمین و حفظ نظم و امنیت عمومی و ارتباط تنگاتنگی که به موجب قانون، بین این وزارتخانه و نیروی انتظامی در جهت تحقق این مهم وجود دارد و به منظور اجرای هرچه شایسته تر فرامین و تدابیر حضرتعالی و انجام وظایف و مسئولیت های قانونی وزارت کشور برای دستیابی به نظمی پویا و امنیتی پایدار؛ از محضر مقام فرماندهی کل قوا استدعا دارد تا در صورت مصلحت اختیارات آن فرماندهی معزز را در امور ناجا، برابر روال گذشته، تحت عنوان جانشین فرماندهی معظم کل قوا در امور نیروی انتظامی، به وزیر کشور تفویض فرمایند.
از خداوند سبحان مسئلت دارم تا در انجام وظایف شرعی و ایفای مسئولیت های قانونی خویش، عنایات خود را شامل حال گرداند و سایه پر ارج و برکت حضرتعالی را بر سر قاطبه مسلمین جهان به ویژه ملت شریف ایران اسلامی مستدام فرماید.
مصطفی محمدنجار»

«بسمه تعالی»
نظر به جهاتی که مرقوم داشته اید شما را به جانشینی فرمانده کل قوا در نیروی انتظامی منصوب می کنم. تفصیل و حدود اختیارات در نامه ی ستاد کل فرماندهی ابلاغ خواهد شد. انشاء الله موفق باشید.
سیدعلی خامنه‌ای
17 آبان ماه 1388