حضرت آیت الله خامنه‌ای، رهبر معظم انقلاب اسلامی طی حکمی حجت‌الاسلام‌والمسلمین سید احمد علم‌الهدی را به امامت جمعه شهر مقدس مشهد منصوب کردند. متن حکم معظم له به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم

جناب مستطاب حجت‌الاسلام و سیدالاعلام آقای حاج سید احمد علم‌الهدی؛ دامت افاضاته

با تکریم یاد امام جمعه‌ی فقید مشهد، مرحوم حجت‌الاسلام عبادی و قدردانی از خدمات و دعا برای علو درجات آن روحانی عالیقدر، جنابعالی را که مزین به زیور علم، و مفتخر به مجاهدت در عرصه‌ی فرهنگ و برخوردار از زبان گویا و نافذ در صحنه‌های دینی و آموزشی می‌باشید، به امامت جمعه‌ی شهر مقدس مشهد و در جوار آستان حضرت ابی‌الحسن الرضا علیه آلاف التحیه و الثنا منصوب می‌کنم. شهر شهادت با مردمی مومن و انقلابی و مهربان و پرافتخار و با حوزه‌ی علمیه‌یی کهن و غنی و ریشه‌دار و با جامعه‌ی دانشگاهی گسترده و روشنفکر و فعال و با میلیون‌ها زائر پرشور و مشتاق، و برتر از همه، با آستان بلند رضوی که قبله‌ی دل‌های مومنان در همه‌ی اقطار است، شهری یگانه و استثنایی به شمار می‌رود و شما که یادگار یکی از برجسته‌ترین خاندان‌های علمی این شهر مقدس می‌باشید با این انتصاب، در جایگاه شایسته‌ی خود قرار گرفته‌اید. اکنون در برابر جنابعالی عرصه‌یی وسیع از تلاش دینی و علمی و اجتماعی و سیاسی قرار دارد و امید است با توفیق و تایید الهی و در پرتو توجهات حضرت بقیه‌الله روحی فداه، هدایت‌های مخلصانه‌ی شما، منشاء برکات و مایه‌ی نشر ایمان و آگاهی و معنویت باشد.

والسلام علیکم و رحمه الله
سید علی خامنه‌ای
‌١٧/ فروردین/ ‌١٣٨٤