حضرت آیت‌الله سیستانی در پیامی به رهبر معظم انقلاب اسلامی شهادت سردار عالیقدر حاج قاسم سلیمانی را تسلیت گفتند.
متن پیام ایشان به شرح زیر است:
 

بسم الله الرحمن الرحیم

انا لله و انا الیه راجعون
جناب مستطاب آیةالله آقای خامنه‌ای دامت برکاته
السلام علیکم و رحمةالله و برکاته
خبر شهادت سردار عالیقدر آقای حاج قاسم سلیمانی رحمةالله‌علیه موجب تأسف و تأثر فراوان شد. نقش کم‌نظیر آن مرحوم در طی سالیان پیکار با عناصر داعش در عراق، و زحمات فراوانی را که در این راستا متحمل شدند فراموش‌ناشدنی است.
اینجانب ضایعه فقدان آن شهید والامقام را به جنابعالی و به فرزندان مکرّم و دیگر بستگان محترمشان و به همه ملت شریف ایران به‌ویژه به مردم عزیز کرمان تسلیت عرض نموده، و از خداوند منّان برای آن فقید سعید علوّ درجات و برای بازماندگان صبر جمیل و اجر جزیل مسألت دارم.

و لاحول و لا قوة الّا بالله العلی العظیم
علی الحسینی سیستانی     
۸ جمادی الاول ۱۴۴۱