متن پیام تسلیت حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به شرح زیر است:
بسمه‌تعالی
درگذشت روحانی پرتلاش مرحومِ مغفور حجت‌الاسلام آقای حاج سید محمدنقی شاهرخی رحمت‌الله‌علیه را که نماینده‌ی مجلس خبرگان و شاگرد و نماینده‌ی امام راحل در برخی کشورها بودند به خاندان محترم و ارادتمندان ایشان و به مردم انقلابیِ خرم‌آباد تسلیت عرض میکنم و مغفرت و رحمت الهی را برای آن مرحوم مسئلت مینمایم. حشر این سید بزرگوار با اجداد طاهرینش باد ان‌شاءالله.
سیدعلی خامنه‌ای
۹ آذرماه ۱۳۹۵