در پی رحلت عالمِ عارف و اخلاقی، مرحوم حجةالاسلام والمسلمین آقای حاج شیخ محمد شجاعی رضوان‌الله‌علیه، رهبر معظم انقلاب اسلامی پیام تسلیتی صادر کردند.
متن پیام تسلیت رهبر معظم انقلاب به این شرح است:
متن پیام تسلیت رهبر معظم انقلاب به این شرح است:
بسم‌الله‌الرحمن‌الرحیم
درگذشت استاد اخلاق و سالک الی‌الله مرحوم حجةالاسلام والمسلمین آقای حاج شیخ محمد شجاعی رضوان‌الله‌علیه را به خانواده‌ی مکرّم و ارادتمندان و شاگردان و مستفیدان از بیانات ایشان تسلیت عرض میکنم. این عالم عارف و اخلاقی با افادات معنوی و اثرگذار خود که برخی از آن از رسانه‌ی ملی پخش می‌شد و با نفس گرم و شیرین خود که از دلی بامعرفت برمیخاست، جوانان و جویندگان بسیاری را به جاده‌ی معارف حقیقی رهنمون بود و دارای حق بزرگی بر جامعه‌ی جوان کشور است. از خداوند متعال بهترین پاداش صالحان را برای این عالم ربانی مسألت میکنم.
سیدعلی خامنه‌ای
۱۲ دی ماه ۱۳۹۴
۱۲ دی ماه ۱۳۹۴