در پی درگذشت عالم بزرگوار جناب حجت‌الاسلام آقای شیخ محمدباقر رفیعی رحمه‌الله علیه، حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی پیام تسلیتی بشرح ذیل صادر فرمودند:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت عالم بزرگوار جناب حجت‌الاسلام آقای حاج شیخ محمدباقر رفیعی رحمه‌الله علیه را به خانواده و بازماندگان محترم ایشان و نیز به عموم مردم شهرری تسلیت عرض می‌کنم.
از خداوند متعال علو درجات و حشر با اولیائش را برای این عالم محترم که عمری را به خدمت در راه دین گذرانیدند مسئلت می‌نمایم.
والسلام علیکم و رحمه‌الله
سیدعلی خامنه‌ای
15-09-1380
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت عالم بزرگوار جناب حجت‌الاسلام آقای حاج شیخ محمدباقر رفیعی رحمه‌الله علیه را به خانواده و بازماندگان محترم ایشان و نیز به عموم مردم شهرری تسلیت عرض می‌کنم.
از خداوند متعال علو درجات و حشر با اولیائش را برای این عالم محترم که عمری را به خدمت در راه دین گذرانیدند مسئلت می‌نمایم.
والسلام علیکم و رحمه‌الله
سیدعلی خامنه‌ای
15-09-1380