در پی درگذشت آیت‌الله حاج شیخ محمد شاه آبادی، رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی ارتحال این عالم ربانی را تسلیت گفتند.
متن پیام به این شرح است:
بسم‌الله‌الرحمن‌الرحیم
ارتحال عالم ربانی، استادزاده‌ی امام بزرگوار، مرحوم آیةالله آقای حاج شیخ محمد شاه آبادی را به خاندان معزّز و مکرّم شاه آبادی و به همه‌ی ارادتمندان و شاگردان ایشان تسلیت میگویم و علو درجات آن روحانی عالیقدر را از خداوند متعال مسألت میکنم.
ارتحال عالم ربانی، استادزاده‌ی امام بزرگوار، مرحوم آیةالله آقای حاج شیخ محمد شاه آبادی را به خاندان معزّز و مکرّم شاه آبادی و به همه‌ی ارادتمندان و شاگردان ایشان تسلیت میگویم و علو درجات آن روحانی عالیقدر را از خداوند متعال مسألت میکنم.
سید علی خامنه‌ای
18/دی/1390