حضرت آیت‌‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی درگذشت استاد سید جلال الدین آشتیانی را تسلیت گفتند. متن پیام به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت فیلسوف علامه بزرگوار مرحوم استاد سید جلال الدین آشتیانی رحمت الله علیه را به همه دوستداران علوم عقلی در حوزه و دانشگاه به ویژه اساتید و دانشجویان فلسفه و عرفان و بالاخص به جمع کثیر شاگردان و بهره‌مندان از آثار آن فرزانه گرانمایه تسلیت عرض می‌کنم.
ایشان یکی از پرورش یافتگان حوزه درسی حضرت امام خمینی(ره) و استاد علامه طباطبایی و خود در شمار برجسته‌ترین اساتید فلسفه و عرفان بودند و فقدان چنین شخصیتی تاسف بار است. از خداوند متعال مغفرت و رحمت واسعه‌اش را برای آن فقید سعید مسالت می‌کنم.
سید علی خامنه‌ای
چهارم فروردین هشتاد و چهار
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت فیلسوف علامه بزرگوار مرحوم استاد سید جلال الدین آشتیانی رحمت الله علیه را به همه دوستداران علوم عقلی در حوزه و دانشگاه به ویژه اساتید و دانشجویان فلسفه و عرفان و بالاخص به جمع کثیر شاگردان و بهره‌مندان از آثار آن فرزانه گرانمایه تسلیت عرض می‌کنم.
ایشان یکی از پرورش یافتگان حوزه درسی حضرت امام خمینی(ره) و استاد علامه طباطبایی و خود در شمار برجسته‌ترین اساتید فلسفه و عرفان بودند و فقدان چنین شخصیتی تاسف بار است. از خداوند متعال مغفرت و رحمت واسعه‌اش را برای آن فقید سعید مسالت می‌کنم.
سید علی خامنه‌ای
چهارم فروردین هشتاد و چهار