حضرت آیت‌الله خامنه‌ای طی حکمی، آیت‌الله سیدمحمود هاشمی را برای یک دوره‌ی پنج‌ساله‌ی دیگر به ریاست قوه‌ی قضائیه منصوب کردند.
متن حکم رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرّحمن الرّحیم
آیت‌الله آقای حاج سیّدمحمود هاشمی شاهرودی (دامت تأییداته)
با پایان گرفتن یک دوره‌ی پنج‌ساله از مسئولیّت جنابعالی در رأس قوّه‌ی قضائیّه که در آن تلاش متراکم و خدمات ارزشمندی مشهود گردید، به موجب اصل یکصد و پنجاه و هفت قانون اساسی، این مسئولیّت را برای یک دوره‌ی دیگر به جنابعالی محوّل میکنم.
بی‌گمان برای رسیدن به دادگستری مطلوب نظام اسلامی که در آن عدل و انصاف، قاطعیّت و قانون، دانش و هوشمندی، اصلاح و تهذیب، سنجیدگی و سرعت، درستکاری و امانت، همه درهم‌تنیده و به‌هم‌آمیخته است، هنوز مجاهدتی برنامه‌ریزی‌شده و فشرده لازم است و اینجانب امید و انتظار دارم که با پیوستن این دوره به مدّت مسئولیّت شما، راه بیشتری بدان‌سو طی شود.
توصیه‌های اینجانب همان است که در حکم پیشین آمده و بر آن تاکید می‌ورزم. ثبات تشکیلات، زمان‌بندی و اجرایی کردن برنامه‌ی تدوین‌شده، پرورش عناصر کارآمد و مؤمن، سپردن سررشته‌های اساسی به افراد شایسته و کاردان، اهتمام به مبارزه با فساد، بهره‌گیری از نظر و مشورت نخبگان قضائی، افزایش تعامل با دیگر قوا، اولویّت‌های قوّه‌ی قضائیّه در این دوره است.
مدیریّت عالِم مجرّب و هوشمندی چون جنابعالی که از چهره‌های برجسته‌ی کشور میباشید، تحقّق این خواسته‌ها را تضمین خواهد کرد؛ ان‌شاءالله.
توفیقات شما را از خداوند متعال مسئلت میکنم.
والسّلام علیکم و رحمه‌الله
سیّدعلی خامنه‌ای
۱۳۸۳/۵/۲۲