حضرت آیت‌الله خامنهای رهبر معظم انقلاب اسلامی امروز به مناسبت درگذشت حضرت آیت‌الله مروارید پیام تسلیتی صادر کردند. متن پیام به این شرح است:
بسم‌الله‌الرّحمن‌الرّحیم
در گذشت عالم ربانی و عبد صالح آیت الله آقای حاج میرزا حسنعلی مروارید (طاب‌ثراه) را به حضرت بقیةالله ارواحنا فداه و نیز به علماء اعلام و حوزه‌ی علمیه و عموم مردم متدین و وفادار مشهد مقدس و به‌ویژه به فرزندان مکرم و معزز و دیگر افراد خاندان محترم ایشان صمیمانه تسلیت عرض می‌کنم.
این عالم جلیل‌القدر عمر پربرکت خود را یکسره با پرهیزگاری و صلاح و سداد گذرانید و در طول سالیان متمادی با رفتار و منش علمی و عملی خویش چهره‌یی نورانی و فراموش نشدنی از خود در خاطره‌ی همه‌ی کسانی که با ایشان آشنا بودند، باقی گذاشتند.
از خداوند متعال علو درجات و رحمت و مغفرت واسعه برای ایشان و اجر جزیل و توفیق برای بازماندگان‌شان مسألت می‌کنم.
سیدعلی خامنهای
۱۳۸۳/۷/۱۵