در جریان برگزاری نهمین دوره انتخابات ریاست جمهوری، آقایان محسن مهر علیزاده و مصطفی معین از سوی شورای نگهبان رد صلاحیت شدند. رد صلاحیت این دو کاندیدا که وابسته به یک جریان خاص قلمداد می‌شدند، باعث بروز نگرانی‌هایی شد. اما حضرت‌آیت‌الله خامنه‌ای، در پی نامه‌‌ی دکتر حدادعادل رئیس مجلس شورای اسلامی، طی نامه‌ای به شورای نگهبان دستور اضافه شدن نام معین و مهرعلیزاده به لیست تایید صلاحیت شدگان را صادر فرمودند.
گفتنی است، در تاریخ 2 خرداد 1384 شورای نگهبان اسامی 6 نامزد تائید صلاحیت شده ریاست جمهوری را اعلام کرده بود:
1-محمود احمدی‌نژاد فرزند احمد
2-علی اردشیر لاریجانی فرزند هاشم
3-محسن رضایی میرقائد فرزند نجف
4-محمدباقر قالیباف فرزند حسین
5-مهدی کروبی فرزند احمد
6-اکبر هاشمی بهرمانی فرزند علی.
در این نامه تأکید شده بود که بر اساس قوانین موجود، امکان ثبت نام برای تمامی ایرانیان که به سن قانونی رسیده‌اند، وجود داشته و وزارت محترم کشور موظف به ثبت نام است؛ اما قانون اساسی شرایط مهم و مؤثری را در انجام وظایف ریاست جمهوری برای داوطلبان در اصل یکصد و پانزدهم قانون اساسی مقرر نموده و وظیفه‌ی تطبیق آن را بر اساس بند 9 اصل یکصد و دهم بر عهده‌ی شورای نگهبان گذارده است.[1]
پس از اعلام این اسامی،  دکتر حداد عادل رئیس وقت مجلس شورای اسلامی در تاریخ 2 خرداد 1384 نامه‌ی به رهبر معظم انقلاب نوشت و برای افزایش مشارکت عمومی تقاضای افزایش تعداد کاندیداها را مطرح کرد: «...چنانکه تجدید نظر در این امر را به مصلحت و مایه‌ی تقویت مشارکت عمومی بیشتر می‌دانید، شورای محترم نگهبان را به توسیع دایره‌ی نامزدهای واجد صلاحیت، دلالت فرمائید.»[2]
رهبر انقلاب در پاسخ به این درخواست در نامه ای به شورای نگهبان ضمن تشکر از تلاش  شورای نگهبان برای احراز صلاحیت داوطلبان ریاست جمهوری دوره‌ی نهم با رعایت موازین قانونی، دستور تایید صلاحیت آقایان معین و مهر علیزاده را صادر فرمودند: «... از آنجا که مطلوب، آن است که همه‌ی افراد کشور از صاحبان سلایق گوناگون سیاسی فرصت و مجال حضور در آزمایش بزرگ انتخابات را بیابند، لذا به نظر می‌رسد نسبت به اعلام صلاحیت آقایان دکتر مصطفی معین و مهندس مهرعلیزاده تجدید‌نظر صورت گیرد.»[3]
پس از این حکم  و با تجدیدنظر شورای نگهبان، تعداد نامزدها در این انتخابات به 8 نفر رسید.

-----------------------------------------------------------------------------
[1] - روزنامه کیهان، 2 خرداد 1384

[2] - روزنامه کیهان، 3 خرداد 1384

[3]- نامه مقام معظم رهبری به شورای نگهبان برای تجدید نظر در صلاحیت کاندیداهای انتخابات ریاست جمهوری