حضرت آیت‌الله خامنه‌ای با صدور پیامی درگذشت عالم پرتلاش، خدوم و بصیر حجت الاسلام سید محسن شفیعی را تسلیت گفتند.
متن پیام به این شرح است:

بسم الله الرّحمن الرّحیم

جناب مستطاب حجة الاسلام و المسلمین آقای حاج سید علی شفیعی دامت برکاته

با تأسف و تأثر خبر درگذشت فرزند عزیز و فاضل حضرتعالی جناب حجة الاسلام آقای سید محسن شفیعی را شنیدم. ایشان نقش ارزشمندی در همه عرصه های علمی و اجتماعی و دانشگاهی خوزستان ایفا می کردند و از امیدهای آینده بودند. فقدان این عالم پرتلاش و خدوم و بصیر خسارتی است که جبران آنرا از خداوند متعال مسألت میکنم.

به جنابعالی و مادر مکرم و همسر و فرزندان گرامی ایشان و دیگر بازماندگان تسلیت عرض میکنم و رحمت و مغفرت الهی برای ایشان مسألت مینمایم.

والسلام علیکم بما صبرتم
سیدعلی خامنه‌ای    
۲۹ اسفند ۱۴۰۰