در پی نامه‌‌ی آقای کروبی رئیس‌ مجلس‌ شورای اسلامی به‌ حضرت‌ آیت‌الله‌ خامنه‌ای رهبر معظم‌ انقلاب‌ اسلامی درخصوص‌ مالیات‌ شرکت‌های تحت‌ پوشش‌ نهادها و بنیادها، رهبر معظم انقلاب با لغو معافیت‌ مالیاتی نهادها و بنیادها به‌ شرح‌ ذیل‌ موافقت‌ فرمودند:
 

بسم‌ الله‌ الرحمن‌ الرحیم‌

جناب‌ حجّت‌الاسلام‌ آقای کرّوبی ریاست‌ محترم‌ مجلس‌ شورای اسلامی
با سلام‌ و تحیّت‌؛ اینجانب‌ علی‌الاصول‌ با لغو هرگونه‌ امتیاز خاص‌ برای نهادها و بنیادها موافقم‌. صرفاً دغدغه‌ی هزینه‌های مأموریّتی این‌ دستگاه‌ها مانند جانبازان‌ عزیز و خانواده‌های معظّم‌ شهیدان‌ و محرومان‌ و مستضعفان‌، ذهن‌ اینجانب‌ را مشغول‌ میکند و اگر این‌ امر به‌نحو مناسب‌ در بودجه‌ی عمومی پیش‌بینی شود و این‌ دستگاه‌ها بویژه‌ آموزشی و فرهنگی، در مورد ایفای وظایف‌ خود دچار کمبود نشوند با لغو معافیت‌ مالیاتی آنها موافقم‌ و از آن‌ حمایت‌ میکنم‌.

سیّدعلی خامنه‌ای
۱۳۸۰/۱۰/۱۵