در پی درگذشت آقای قاضی ملا محمد خضری رهبر انقلاب پیام تسلیتی به این شرح صادر کردند:

بسم‌اللَّه‌الرّحمن‌الرّحیم

انّاللَّه و انّا الیه راجعون

درگذشت عالم عامِل و روحانی روشن‌بین و آگاه، مرحوم آقای قاضی ملامحمد خضری موجب تأثر و تأسف این‌جانب گردید. این عالم جلیل از جمله‌ی شخصیتهای برجسته‌یی بود که در منطقه‌ی کردستان و آذربایجان غربی به وظایف خطیر علمای اسلام در نظام مقدس جمهوری اسلامی شجاعانه قیام کرد و در راه تقویت پیوندهای برادری میان پیروان فِرق اسلامی در این منطقه تلاشی پیگیر و گسترده انجام داد، مواقف و مواضع حکیمانه و خیرخواهانه‌ی او در دفاع از نظام مقدس جمهوری اسلامی و مسؤولان کشور یکی از برجسته‌ترین کارهای آن عالم جلیل است که حاکی از شخصیت قوی و روح بلند و احساس مسؤولیت عمیق او است.

این‌جانب درگذشت این بزرگوار را به همه‌ی برادران مسلمان کرد و به همه‌ی مردم این منطقه و بخصوص به مردم عزیز اشنویه و نیز به علمای اعلام و به خانواده‌ی محترم ایشان تسلیت می‌گویم و رحمت و مغفرت الهی را برای ایشان مسألت می‌نمایم.

والسّلام علیکم و رحمةاللَّه و برکاته

سید علی خامنه‌ای

8/2/77