در پی در‌گذشت آیت‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌الله پسندیده برادر گرامی حضرت امام خمینی(رض)، پیام تسلیتی از سوی حضرت آیت‌‌الله خامنه‌‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی صادر گردید. متن پیام به این شرح است:
بسم‌الله الرحمن‌الرحیم‌
انالله و اناالیه راجعون‌
برادر بزرگ و بزرگوار امام راحل عظیم‌‌‌‌الشأن جناب حجت‌‌الاسلام آقای حاج سید مرتضی پسندیده پس از عمر بابرکتی که یکسره به تقوا و پاکدامنی سپری شد، به دیار باقی و دیدار احبّه و اولیاء شتافت.
رحمت و فضل خدا بر او و سزای پرهیزکاران و پاکدامنان نثار او باد. این روحانی شریف و امین و شجاع و صادق، برای امام کبیر ما، در یک دوره همچون پدر و سرپرستی مهربان و دلسوز و مصلحت‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌اندیش، و در یک دوره همچون برادر و وکیل و معاونی موتمن و رشید و خستگی ناپذیر، و بالاخره در یک دوره همچون رعیت و پیروی مؤمن و فرمان‌‌‌‌پذیر و مطیع بود. این افتخار برای او بس که بزرگترین انسان زمان ما همواره او را بزرگ و گرامی می‌‌داشت و به او احترام می‌‌کرد. از او راضی بود و به حفظ رضایت او، اهتمام می‌‌ورزید.
این موجود عزیز و مکرم اکنون از میان ما رفته و به جوار رحمت و مغفرت حق‌تعالی پیوسته است.
تکریم یاد و نام امام عظیم‌‌‌‌الشأن، مقتضی تکریم و تجلیل اوست.
اینجانب این مصیبت را به بیت شریف و معزز حضرت امام خمینی رضوان الله علیه ‌بویژه به فرزندان و بازماندگان محترم آن مرحوم صمیمانه تسلیت می‌‌گویم و علو درجات آن روحانی عالی‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌قدر را از خداوند متعال مسألت می‌‌‌‌‌‌نمایم.
سید علی خامنه‌‌‌‌ای
23 آبان 75